Ulva rigida'nın Üzerinde Epifitik Yaşayan Bakterilerin Morfogenez Üzerine Etkilerinin Belirlenmesi ve Tanımlanması


Ünal D., Öztürk yiğit E., Tüney kızılkaya İ., Arslan aydoğdu E. (Araştırmacı)

  • Proje Türü: TÜBİTAK - AB COST Projesi
  • Proje Grubu: Fen ve Mühendislik
  • Başlangıç Tarihi: Temmuz 2024
  • Bitiş Tarihi: Temmuz 2027

Özet

Dünyanın çeşitli bölgelerinde yayılış gösteren makroalg türlerinin her birinin heterotrofik epifitik bakterilere sahip olduğu ve yaşam döngülerinin bu bakteriler ile ilişkili olduğu bilinmektedir. Alg-mikroorganizma etkileşimlerini anlamak ve bu bakterilerin alg büyümesi, gelişimi ve morfogenezini nasıl etkilediğini belirlemek için yeşil alglerden Ulva cinsi en iyi model sistemlerden biri olarak tanımlanmaktadır. Bunun yanı sıra, farmasötik alandan tarıma kadar birçok alanda pazar payına sahip Ulva türlerinin kültüre alınabilir bir makroalg olmasından dolayı yaşam döngüsü ile ilişkili bakterilerin tanımlanması da araştırmacıların ilgisini çekmektedir. Özellikle çevresel koşullar ve ekosisteme bağlı olarak Ulva’nın yaşam döngüsünde yer alan bakteri/lerin tür bazında çeşitlilik gösterdiği de bilinmektedir. Dolayısıyla ülkemizde yayılış gösteren Ulva türlerinin ticari ürün elde edilmesine yönelik yetiştiriciliğinin standardizasyonu ve sürdürülebilirliğin sağlanması açısından bu bakterilerin tanımlanması oldukça önemlidir. Önerilen bu projede ülkemizde yayılış gösteren ve ekonomik açıdan da önemli olan U. rigida türünün kültüre alınması ve morfogenezinde etkin olan bakterilerin tanımlanması amaçlanmaktadır. Bu kapsamda U. rigida türünün doğada iyi bir gelişme gösterdiği ilkbahar ve sonbahar dönemlerinde arazi çalışması yapılacaktır. Mevsimsel değişime bağlı farklılık ve benzerlik gösteren epifitik bakterilerin belirlenmesi için hem metagenomik analizler hem de kültüre dayalı yöntemler kullanılacaktır. İzole edilebilen bakteriler, kültürü yapılan U. rigida’ya inokule edilerek gametogenez ve morfogenez üzerindeki etkileri; büyüme oranı, zoospor oluşumu ve SEM görüntüleme ile belirlenecektir. Deneyler sonucu U. rigida’nın yaşam döngüsünde aktif rol oynadığı belirlenen izolatlar 16S rRNA analizi ile tanımlanacaktır. Ülkemizde Ulva türlerinin kültüre alınması ve yüksek verimli kültür ortamı için gerekli bakteri çeşitliliğinin tanımlanması açısından önemli bir boşluk bulunmaktadır. Bu açıdan bu proje, Ulva kültürüne ilişkin çalışmalara öncülük ederek farklı araştırmalar ve projelerin geliştirilmesine önemli bir katkı sağlayacaktır.